毒枭康素差（刘青云 饰）一直带着手下张建行（郭富城 饰）从事毒品交易，新加入的成员欧志远（古天乐 饰）也因一次意外与两人有了过命交情，三人情同手足。康素差在香港的贩毒生意被警方查处后带团队逃到金三角发展，却意外发现身边藏有卧底。此刻，是敌是友，一片茫然。
本片讲述了辛亥革命时期的上海，爱国武师霍振山、何大川携手烧毁大烟馆，引来斧头帮追杀，何大川为助义兄霍振山脱困被杀。二十年后的霍振山在上海开起武馆发扬中华武术，并寻找何大川的后人。面对黑市拳庄的挑战，霍振山击败对手却拒绝领取赏金，让赶来观战的石头心生敬意。而大弟子黄锦鹏却暗中勾结拳庄老板，害死师傅。石头和黄锦鹏在比武中发现彼此身世，竟是何大川失散多年的孩子，二人携手击败了拳市经理，铲平了黑市拳庄。
《特种兵归来4-替身疑云》 延续了前几部的故事背景，讲述藤国犯罪集团卷土重来，派出绰号为死神的组织元老启动“重生”计划，犯下抢劫国宝、政治刺杀等重大案件。在阴谋下，龙卫小队蒙受莫须有的罪名，为洗白冤屈联合雅塔、猴子发起反击。几人在经过缜密的计划后，层层攻破敌人关卡，使得真相逐渐浮出水面。最终龙卫等人找到了死神的老巢—末日迷宫。并与敌人展开殊死较量……
