工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！
尾行琳（水树奈奈 配音）的母亲是一位著名的芭蕾舞演员，母亲优雅的身姿深深的映在琳的眼眸深处，琳以成为和母亲一样的芭蕾舞演员为目标开始了努力。然而，一场大地震夺走了母亲的生命，之后，琳又因为受伤而再也无法跳芭蕾，无奈之中放弃了梦想。 琳进入了武藏野文艺大学，成为了校园中的新鲜人，某日偶然之中，琳来到了“Rideback部”门前，推开门，见到了名为菱田春树（上田佑司 配音）的男子以及一台“Rideback”，这一瞬间，琳的命运被改变了。成熟稳重的基弗（森川智之 配音）、大大咧咧元气满满的片冈珠代（朴璐美 配音）等人接二连三的出现在琳的身边，他们同为Rideback的骑手，拥有同样澄澈向往自由的灵魂。
